İnebahtı mağlubiyeti, Akdeniz'de birçok ada ve sahillere sahip olan Osmanlı Devleti'nin donanmasının mühim bir kısmının kaybına sebep olmuştu. Yeni Kaptan-ı Derya Kılıç Ali Paşa, Haçlı donanmasının herhangi bir taarruz ihtimalinden dolayı çok telaş ediyordu. Kış mevsimi boyunca bütün Osmanlı tersaneleri gemi inşasıyla meşguldü. Kılıç ali Paşa, leventlikten yetişme olup devletin esas teşkilatını bilmediğinden her zaman Vezir-i Azam Sokullu Mehmed Paşa'ya:

 "Tekne inşa etmek mümkündür, fakat mesela iki yüz gemiye beş altı yüz lenger ( gemi demiri ), palamar (halat) ve ip ve her gemiye yelken ve sairenin tedarikine imkan yoktur." dermiş. Sokullu, Kaptan Paşa'ya:

 "Paşa hazretleri, sen henüz bu Devlet-i Aliyye'yi tanıyamamışsın. Böyle itikat eyle; bu devlet ol devlettir ki murad edinirse cümle donanmanın lengerlerini gümüşten, resenlerini ( iplerini ) ibrişimden, yelkenlerini atlastan etmekte zorluk çekmez. Hangi geminin halatını ve yelkenini yetiştiremezsen benden al." deyince, Kılıç Ali Paşa hemen Sokullu'nun elini öpmüş ve:

 " Hakikaten bildim ki donanmayı siz tekmil edeceksiniz." demiştir.

 İşte bu mükemmel teşkilat ve gayret sayesinde beş buçuk ay zarfında her şey hazırlanarak iki yüzden fazla kadırga ve mavuna, donanmış olarak ilkbahardan evvel Kaptan Paşa'nın emrine verilmiştir.

 Mustafa Selaniki Efendi'nin, Osmanlı tarihine dair yazdığı kitap, "Selaniki Tarihi" ismiyle meşhur olmuştur. Selaniki, muasırı olduğu Klasik Türk Edebiyatımızın en büyük şairlerinden Baki'nin vefatını, tarihinde "Merhum Mevlana Abdülbaki Efendi İntikalidir" başlığı altında şöyle anlatmaktadır:

 " Ramazan-ı Şerif'in sonlarında mütebahhir ulemadan, ehl-i yakin zümresi içinde cümleden mümtaz, Osmanlı padişahları tarafından türlü türlü izaz ve ikramlarla kendisine iltifat olunmuş, nice kere yüksek makamlara getirilmiş Abdülbaki Efendi vefat etti. Geçen padişahların zamanlarında olmasıyla övündükleri tarafımdan defalarca işitilmiştir. Mirahur Ferhad Ağa'dan da işitmişimdir ki Kanuni Sultan Süleyman Han Hazretleri şöyle buyurmuşlardır: "Padişahlığımın sevinç duyduğum birkaç yeri vardır. Bunlardan biri de Abdülbaki Efendi gibi temiz yaratılışlı, cevahir bir zatı bulup çıkarıp kadr ü kıymet verdiğimdir."

 Sultan İkinci Selim Han ve Sultan Üçüncü Murad Han dahi onun hakkında " İlim ve fazilet ile nazım letafeti ve kelam ve beyan kuvveti insana ancak bu denlü mümkün ve müyesserdir." derlermiş.

 Mekke-i Mükerreme ve İstanbul'da kadı olup üç defa Anadolu ve iki defa Rumeli kazaskerliği ile müşerref olmuşlardı. Yaşlı olup, bu sebeple çeşitli hastalıklar geçirip sıhhat ve afiyete yüz tutmuş iken ansızın ruhları alem-i kudse uçmuştur. Bütün halk toplanıp vezirler, ulema, şeyh efendiler, Fatih Sultan Mehmed Han Camii'nde büyük bir cemaat halinde cenazesinde hazır olup ruhlarına dualar eylediler.